V Knihovně Národního muzea (KNM) se výzkum v minulých letech soustředil především na zpracování knižních proveniencí (MK ČR NAKI PROVENIO: metodika výzkumu knižních proveniencí, 2012–2015). Hlavními výstupy tohoto projektu jsou kromě publikace Ex libris... Ex bibliotheca...: knižní sbírky Knihovny Národního muzea a jejich dřívější majitelé a řady studií také aplikované výstupy a rovněž databáze proveniencí. Dalším grantem NAKI řešeným v KNM byl projekt Tisky 16. století v zámeckých knihovnách České republiky (ve spolupráci s Národním památkovým ústavem a Národní knihovnou ČR), jehož hlavním publikačním výstupem je stejnojmenný třísvazkový katalog. Na oba projekty v současné době navazuje grant MK ČR NAKI II Virtuální rekonstrukce rozptýlených provenienčně bohemikálních knižních celků v tuzemských i zahraničních knihovnách (2018–2022).
Paralelně s řešením projektů NAKI probíhal také výzkum v rámci výzkumných cílů institucionální podpory dlouhodobého koncepčního rozvoje výzkumné organizace (IP DKRVO). V letech 2012–2017 byla pozornost zaměřena především na zpracování bohatého fondu rukopisných zlomků uloženého v oddělení rukopisů a starých tisků KNM. Hlavními výstupy tohoto výzkumu jsou katalogy zpracovávající fond po jednotlivých signaturních řadách – poslední díl Rukopisné zlomky Knihovny Národního muzea. Signatura 1 K (Dodatky ke sbírkám Adolfa Patery a Čeňka Zíbrta) vyšel v roce 2017. Rovněž z prostředků DKRVO byla ve spolupráci s nakladatelstvím Academia vydána publikace Liber viaticus Jana ze Středy: zmenšená reprodukce a komentářový svazek (2017) jednoho z nejvýznamnějších středověkých rukopisů uložených v KNM. V letech 2017–2018 probíhal v rámci DKRVO rovněž hmotný průzkum Rukopisů královédvorského a zelenohorského, jehož hlavním cílem bylo zjistit aktuální stav těchto rukopisných památek. Hlavním výstupem tohoto vědeckého cíle je monografie Hmotný průzkum Rukopisů královédvorského a zelenohorského: dokumentace současného stavu, opatřená bohatým obrazovým doprovodem. Dále v KNM probíhá (rovněž z prostředků DKRVO) výzkum slovanských fondů, kramářských tisků (viz databáze Špalíček) a jejich producentů v geografickém kontextu a započaty byly také přípravné práce na vydání Sebraných spisů Ferdinanda Peroutky.
KNM má na starosti vědecký časopis Acta Musei Nationalis Pragae – Historia litterarum (od roku 1956 do roku 2016 vydávaný pod názvem Sborník Národního muzea, řada C – Literární historie) zaměřený na literární historii, knihovědu a knižní kulturu.
Přehled monografií publikovaných od roku 2008
2023
ŘEHÁK, Daniel (ed.). Ferdinand Peroutka. Juvenilní texty 1913–1918. Praha: Národní muzeum, 2023. ISBN 978-80-7036-812-1 (pdf).
SPURNÁ, Kateřina. Druhá staroslověnská legenda o sv. Václavu. Praha: Národní muzeum, 2023. ISBN 978-80-7036-817-6 (pdf).
2022
KAŠPAROVÁ, Jaroslava – MAŠEK, Petr – MĚŘIČKA, Matěj – ŠÍPEK, Richard. Fragmenty českých knižních sbírek v evropských knihovnách. Žitava, Drážďany, Vratislav, Vídeň, Řezno, Paříž. Praha: Národní muzeum 2022. ISBN 978-7036-739-1.
HÁJEK, Pavel (ed.) et al. Krása šlechtických exlibris a supralibros: katalog výstavy: Státní zámek Konopiště, 25.7.-25.9.2022. České Budějovice: Národní památkový ústav, územní odborné pracoviště v Českých Budějovicích, 2022. ISBN 978-80-88446-01-9.
2021
BENDOVÁ, Lenka – BISOVÁ, Jana – MAŠEK, Petr – KRYŠTŮFEK, Jan. Zámecké knihovny jihozápadní Moravy. Praha: Národní muzeum, 2021. ISBN 978-80-7036-690-5.
NEBESKÁ, Barbora – MAŠEK, Petr. Slezské zámecké knihovny: katalog výstavy: Státní zámek Hradec nad Moravicí, 23.9-26.12.2021. České Budějovice: Národní památkový ústav, územní odborné pracoviště v Českých Budějovicích, 2021. ISBN 978-80-85033-98-4.
HÁJEK, Pavel – ŠÍPEK, Richard (edd.) et al. V nejhlubší úctě: katalog výstavy: Státní zámek Kozel, 1.6.-31.7.2021. České Budějovice: Národní památkový ústav, územní odborné pracoviště v Českých Budějovicích, 2021. ISBN 978-80-85033-96-0.
BOK, Václav – VODRÁŽKOVÁ, Lenka (edd.). Cesty a život Jindřicha Hýzrla z Chodů. I. Zmenšené faksimile, II. Studie, edice a překlad. Praha: Národní muzeum, 2021. ISBN 978-80-7036-674-5 (soubor), 978-80-7036-675-2 (1. sv.), 978-80-7036-676-9 (2. sv.), 978-80-7036-692-9 (pdf).
2020
ŠÍPEK, Richard (ed.). Vzdělaný čtenář: katalog výstavy: Státní zámek Kynžvart, 8.8.-10.10.2020. České Budějovice: Národní památkový ústav, územní odborné pracoviště v Českých Budějovicích, 2020. ISBN 978-80-85033-93-9.
2018
KŘENEK, Karel – OHLÍDALOVÁ, Martina – PECH, Michal – TVRZNÍKOVÁ, Jana. Hmotný průzkum Rukopisů královédvorského a zelenohorského. Praha: Národní muzeum, 2018. ISBN 978-80-7036-568-7.
[(rec.) Široký, Miroslav. Acta Musei Nationalis Pragae – Historia litterarum 65, 2020, č. 1–2, s. 90–91.]
2017
DRAGOUN, Michal. Rukopisné zlomky Knihovny Národního muzea: signatura 1 K (Dodatky ke sbírkám Adolfa Patery a Čeňka Zíbrta). Praha: Národní muzeum, Scriptorium, 2017. ISBN 978-80-7036-537-3.
[(rec.) DOLEŽALOVÁ, Lucie. Studia mediaevalia Bohemica 9, 2017, č. 2, s. 274–276.]
[(rec.) MODRÁKOVÁ, Renáta. Acta Musei Nationalis Pragae – Historia litterarum 64, 2019, č. 3–4, s. 56–58.]
2016
BRODSKÝ, Pavel – SPURNÁ, Kateřina – VACULÍNOVÁ, Marta (edd.). Liber Viaticus Jana ze Středy: zmenšená reprodukce a komentářový svazek. Praha: Academia, Národní muzeum, 2016. ISBN 978-80-200-2553-1, 978-80-200-2553-1.
[(rec.) GAUDEK, Tomáš. Studia mediaevalia Bohemica 9, 2017, č. 1, s. 127–128.]
[(rec.) PRŮŠA, Lukáš. Česká literatura 66, 2018, č. 3, s. 438–440.]
[(rec.) DIENSTBIER, Jan. Acta Musei Nationalis Pragae – Historia litterarum 64, 2019, č. 1–2, s. 65–68.]
[(rec.) NODL, Martin. Český časopis historický 118, 2020, č. 2, s. 482–485.]
V roce 2018 získala publikace ocenění Magnesia Litera za nakladatelský čin.
BROM, Vlastimil et al. Rukopisné zlomky Knihovny Národního muzea: signatury 1 D, 1 E a 1 G. Praha: Národní muzeum, Scriptorium, 2016. ISBN 978-80-7036-493-2, 980-80-88013-36-5.
[(rec.) VELIČKA, Tomáš. Studia mediaevalia Bohemica 9, 2017, č. 2, s. 273–274]
[(rec.) MODRÁKOVÁ, Renáta. Acta Musei Nationalis Pragae – Historia litterarum 64, 2019, č. 1–2, s. 69–73.]
2015
BENEŠ, Jiří et al. Rukopisné zlomky Knihovny Národního muzea. Signatury 1 B a 1 C. Praha: Národní muzeum, Scriptorium, 2015. ISBN 978-80-7036-448-2.
[(rec.) VELIČKA, Tomáš. Studia mediaevalia Bohemica 9, 2017, č. 1, s. 110–111.]
[(rec.) MODRÁKOVÁ, Renáta. Acta Musei Nationalis Pragae – Historia litterarum 63, 2018, č. 3–4, s. 207–211.]
KAŠPAROVÁ, Jaroslava – ŠÍPEK, Richard – VACULÍNOVÁ, Marta (edd.). Ex libris... Ex bibliotheca… Knižní sbírky Knihovny Národního muzea a jejich dřívější majitelé. Praha: Národní muzeum, 2015.
MAŠEK, Petr et al. Tisky 16. století v zámeckých knihovnách České republiky. I–III. Praha: Národní muzeum, 2015.
[(rec.) HLAVÁČEK, Ivan. Český časopis historický 114, 2016, č. 3, s. 768–774.]
[(rec.) JELÍNKOVÁ, Andrea. Knihy a dějiny 23, 2016, č. 1–2, s. 167–168.]
[(rec.) PROKOPOVÁ, Zdeňka. Jihočeský sborník historický 85, 2016, s. 470–472.]
[(rec.) PÁNEK, Jaroslav. Folia Historica Bohemica 33, 2018, č. 1, s. 245–247.]
[(rec.) PÁNEK, Jaroslav. In: Bollettino dell'Istituto Storico Ceco di Roma 11, 2018, s. 159–161.]
[(rec.) PAVELKOVÁ, Jindra. Acta Musei Nationalis Pragae – Historia litterarum 64, 2019, č. 1–2, s. 98]
STEJSKALOVÁ, Eva. Novinové zpravodajství a noviny v Čechách od 17. století do roku 1740. Praha: Nakladatelství Karolinum, Národní muzeum, 2015.
[(rec.) KUBÍČEK, Jaromír. Časopis Matice moravské 134, 2015, č. 2, s. 557–561.]
[(rec.) ŠIMEČEK, Zdeněk. Slovanský přehled 102, 2016, č. 1, s. 130–133.]
[(rec.) VANĚK, Václav. Dějiny a současnost 38, 2016, č. 6, s. 50.]
[(rec.) PRAŽÁKOVÁ. Kateřina. Opera historica 17, 2016, č. 1, s. 133–134.]
[(rec.) FEJTOVÁ, Olga. Bohemia. Zeitschrift für Geschichte und Kultur der böhmischen Länder 56, 2016, č. 1, s. 210–212.]
[(rec.) PRAŽÁKOVÁ, Kateřina. Acta Musei Nationalis P ragae – Historia litterarum 64, 2019, č. 1–2, s. 78–79.]
2014
BRČÁK, Marek et al. Rukopisné zlomky Knihovny Národního muzea. Signatura 1 A. Praha: Národní muzeum, Scriptorium, 2014. ISBN 978-80-7036-421-5.
[(rec.) MAREK, Jindřich. Studia mediaevalia Bohemica 7, 2015, č. 1, s. 152.]
[(rec.) MODRÁKOVÁ, Renáta. Acta Musei Nationalis Pragae – Historia litterarum 63, 2018, č. 1–2, s. 50–53.]
KAŠPAROVÁ, Jaroslava. Amadis Waleský, nebo Don Quijote? Rytířské příběhy španělského Zlatého věku a jejich putování za čtenáři 16.–19. století. České Budějovice: Veduta, Praha: Národní muzeum, 2014. ISBN:978-80-86829-95-1, 978-80-7036-422-2.
[(rec.) BAĎUROVÁ, Anežka. Knihy a dějiny 22, 2015, č. 1–2, s. 114–117.]
ŠÍPEK, Richard. Die Jauerer Schlossbibliothek Ottos des Jüngeren von Nostitz. Teil 1–2. Frankfurt am Main: PL Academic Research, 2014. ISBN 978-3-631-65029-5.
[(rec.) KUCHAŘOVÁ, Hedvika. Knihy a dějiny 22, 2015, č. 1–2, s. 107–108.]
[(rec.) KNIELING, Nina. Mitteilungen des Instituts für Österreichische Geschichtsforschung 124, 2016, č. 1, s. 226–228.]
[(rec.) HABERLAND, Detlef. Zeitschrift für Ostmitteleuropa-Forschung 66, 2017, č. 1, s. 120–121.]
2012
DRAGOUN, Michal – MAREK, Jindřich. Rukopisné zlomky Knihovny Národního muzea: sbírky Adolfa Patery a Čeňka Zíbrta. Praha: Národní muzeum, Scriptorium, 2012. ISBN 978-80-7036-350-8, 978-80-87271-68-1.
[(rec.) HLAVÁČEK, Ivan. Deutsches Archiv für Erforschung des Mittelalters 69, 2013, č. 1, s. 261.]
[(rec.) PETR, Stanislav. Studie o rukopisech 42, 2012 [2013], s. 176–180.]
[(rec.) VELIČKA, Tomáš. Studia medievalia Bohemica 5, 2013, č. 2, s. 326–327.]
[(rec.) MODRÁKOVÁ, Renáta. Acta Musei Nationalis Pragae – Historia litterarum 62, 2017, č. 3–4, s. 46–49.]
2011
DRAGOUN, Michal. Soupis středověkých rukopisů Knihovny Národního muzea. Doplňky ke katalogům F. M. Bartoše, J. Vašici a J. Vajse. Národní muzeum, Scriptorium, Praha: 2011. ISBN 978-80-7036-301-0, 978-80-87271-37-7.
[(rec.) Sborník Národního muzea – řada C, literární historie 56, 2011, č. 1–2, s. 23–24.]
[(rec.) ŠEDIVÝ, Juraj. Studie o rukopisech 41, 2011, s. 249–282.]
[(rec.) MAREK, Jindřich. Studia mediaevalia Bohemica 4, 2012, č. 1, s. 137–138.]
[(rec.) SPUNAR, Pavel. Listy filologické 136, 2013, č. 3–4, s. 534–535.]
2010
ANTONÍN, Luboš. Zlatý věk svobodného zednářství v Čechách. Praha: Argo, 2010. ISBN 978-80-257-0317-5.
KAŠPAROVÁ, Jaroslava. České země a jejich obyvatelé očima románského světa 16.–17. století. České Budějovice: Veduta, 2010. ISBN 978-80-86829-53-1.
[(rec.) BRADÁČOVÁ, Michaela. Z Českého ráje a Podkrkonoší 25, 2012, s. 350.]
[(rec.) BAĎUROVÁ, Anežka. Knihy a dějiny 18–19, 2012 [2013], č. 1–2, s. 149–151.]
MAŠEK, Petr. Šlechtické rody v Čechách, na Moravě a ve Slezsku o Bílé hory do současnosti. Díl. II. N–Ž. Praha: Argo, 2010. ISBN 978-80-257-0294-9.
[(rec.) MALINOVSKÝ, Anton František. Genealogické a heraldické listy. Acta genealogica ac heraldica 30, 2010, č. 3, s. 92.]
[(rec.) WALTER, Vilém. Genealogické a heraldické informace 15(30), 2010, s. 165–167.]
[(rec.) Sborník Národního muzea – řada C, literární historie 56, 2011, č. 1–2, s. 23.]
2009
BOLDAN, Kamil et al. Jenský kodex. Praha: Gallery, 2009.
[(rec.) BARTLOVÁ, Milena. Studia mediaevalia Bohemica 2, 2010, s. 2, s. 331–333.]
[(rec.) BOUBÍN, Jaroslav. Český časopis historický 108, 2010, č. 4, s. 728.]
[(rec.) ČORNEJ, Petr. Marginalia historica 1, 2010, č. 2, s. 112–115.]
[(rec.) MAREK, Jindřich. Mediaevalia Historica Bohemica 15, 2012, s. 1, s. 118–119.]
2008
MAŠEK, Petr. Šlechtické rody v Čechách, na Moravě a ve Slezsku o Bílé hory do současnosti. Díl. I. A–M. Praha: Argo, 2008. ISBN 978-80-257-0027-3.
[(rec.) DROZD, Arnošt. Genealogické a heraldické listy. Acta genealogica ac heraldica. 28, 2008, č. 3, s. 74–75.]
[(rec.) KUBEŠ, Jiří. Cornova. Revue České společnosti pro výzkum 18. století a Filozofické fakulty Univerzity Karlovy v Praze. 1, 2011, č. 2 s. 68–70.]
[(rec.) WALTER, Vilém. Genealogické a heraldické informace 15(30), 2010, s. 165–167.]
[(rec.) Sborník Národního muzea – řada C, literární historie 56, 2011, č. 1–2, s. 23.]
MAŠEK, Petr et al. Zámecké knihovny ve Zlínském kraji. Zlín: Krajská knihovna Františka Bartoše ve Zlíně, 2008. ISBN 978-80-86886-29-9