Mechanismy stárnutí a senescence u volně žijích ptáků (GAČR)
Členství ve vědeckých organizacích
Česká společnost ornitologická
Český Ramsarský výbor
Pedagogická činnost
přednáška Avifauna Evropy, terénní cvičení ze zoologie (PřF UK)
Publikační činnost (výběr)
Storch D, Gaston KJ & Cepák J 2002: Pink landscapes: 1/f spectra of spatial environmental variability and bird community composition. Proceedings of the Royal Society B 269: 1791–1796.
Cepáková E, Šálek M, Cepák J & Albrecht T 2007: Breeding of Little Ringed Plovers Charadrius dubius in farmland: do nests in fields suffer from predation? Bird Study 54: 284–288.
Cepák J, Klvaňa P, Škopek J, Schröpfer L, Jelínek M, Hořák D, Formánek J & Zárybnický J 2008: Atlas migrace ptáků České republiky a Slovenska. Aventinum, Praha, 607 pp.
Adamík P, Hušek J & Cepák J 2009: Rapid decline of Common Cuckoo Cuculus canorus parasitism in Redbacked Shrikes Lanius collurio. Ardea 97: 17–22. DOI: 10.5253/078.097.0103
Laskemoen T, Albrecht T, Bonisoli-Alquati A, Cepák J, de Lope F, Hermosell IG, Johannessen LE, Kleven O, Marzal A, Mousseau TA, Moller AP, Robertson RJ,Rudolfsen G, Saino N, Vortman Y, Lifjeld JT 2013: Variation in sperm morphometry and sperm competition among barn swallow (Hirundo rustica) populations. Behavioral Ecology and Sociobiology 67: 301–309 (DOI: 10.1007/s00265-012-1450-0)
Hušek J, Adamík P, Albrecht T, Cepák J, Kania W, Mikolášková E, Tkadlec E & Stenseth NC 2013: Cyclicity and variability in prey dynamics strengthens predator numerical response: the effects of vole fluctuations on white stork productivity. Population Ecology 55: 363-375. DOI: 10.1007/s10144-013-0366-